La Facultad de Ciencias, es una unidad académica de la UNE, comprometida con la educación del Perú. En ella, formamos personas con una cultura educativa basada en el aprender a aprender y en el pensar, que se sientan comprometidas con su institución y con su comunidad, que trabajen para mejorarla, que sean líderes y agentes del cambio en nuestra institución, comunidad y el país, en la perspectiva de construir una sociedad más desarrollada, justa y más libre.
Estructuralmente ha cambiado, ahora se cuenta con dos escuelas profesionales: La Escuela Profesional de Ciencias Naturales, conformada por los Departamentos Académicos de Biología, Química y Física; la Escuela Profesional de Matemática e Informática que comprende, el Departamento Académico de Matemática e Informática, de acuerdo al nuevo Estatuto de la UNE y sus modificatorias.